São atribuições gerais do INS:
- Apoiar a implementação de políticas e avaliação de estratégias na área de investigação em saúde a nível local, velando pela sua correcta implementação, monitoria, fiscalização e avaliação periódica;
- Promoção do desenvolvimento da investigação em Saúde aos diferentes níveis de atenção, para garantia de uma melhor definição de Política de Saúde e gestão de programas, com o objectivo de dar resposta atempada e eficaz aos problemas de saúde;
- Realização de investigação clínica, biomédica, farmacológica, epidemiológica, operacional, sócio-antropológica e em sistemas de saúde, com base nas prioridades nacionais;
- Contribuição para o desenvolvimento, avaliação e promoção do uso de tecnologias apropriadas de saúde;
- Contribuição para a prevenção e controlo das doenças endémicas e epidémicas, e para a gestão de eventos especiais de Saúde Pública;
- Contribuição para o desenvolvimento de recursos humanos, em particular na área técnicoprofissional e científica especifica para a saúde;
- Realização do controlo de qualidade das análises laboratoriais, através de um sistema de referência laboratorial;
- Divulgação de informação de carácter técnico-científico, para a comunidade científica, trabalhadores de saúde e público em geral;
- Realização de Observação em Saúde, para documentar o Estado de Saúde da População e seus Determinantes;
- Realização de parcerias com outras instituições nacionais e internacionais.