O Laboratório de serologia realiza testagem serológica usando testes comerciais para uma grande variedade de patógenos e biomarcadores.Este laboratório serve de referencia nacional para vigilância de casos de serologia de sarampo, rubéola e HIV e referenciamento de casos de HIV indeterminados, HIV-2 e HTLV 1-2, e realiza treinos e supervisões no Serviço Nacional de Saúde. Esta plataforma além de fornecer painéis de proficiência para a testarem rápida de HIV no SNS, também realiza actividades de validação de lotes de HIV, Hepatite B e Hepatite C antes destes serem distribuídos as Unidades Sanitárias